mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GTTCAAGAAAGTTGTGGGAAA CTGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCCGCTCGTCGTGTTCGTACGTCTCCTCTAACTAATTACATTCATGGTGATCATGTTTATGGTGGAGGAGATCCACGAGGCGAACCGAATCCATAAAATTCACCATGGAAAGTTCAAGAAAGTTGTGGGAAAATATGGCG CTTCCTTTCTTTATCTCACTTTTTTTGTTATCTCTCTCTTAATTCATTCCACCTCTTTCAACCTTTCATTTTCTCTCTAATCTTCTCCTTCTTCTTTAGCTAGCTAGCGGTGAAAGTAAAATAAGTCCTGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCCGCTCGTCGTGTTCGTACGTCTCCTCTAACTAATTACATTCATGGTGATCATGTTTATGGTGGAGGAGATCCACGAGGCGAACCGAATCCATAAAATTCACCATGGAAAGTTCAAGAAAGTTGTGGGAAAATATGGCGTTTTTCAGGACTTTGGCTTCTGTTAAGTGTTATGCTTTCACATAGATCAGATGGGTCTTTTGTATATGAAGAAAAGAGAGAAGATTCTCAACCTTTTCCTTTTGTCACTCAGATCAGAGATGATGATGATAATGATAAGTCTCCCCTTATTGTCTTCTGGGTTTTTATTTTTCTATTCATGTAAGCATTCCACTTTAAAAAAGAAAAAAAAAAGTTTACCTTTTGGCTATATCTTCATATATTTATTGGAAAAAATTCTTTACTTTTTATACTCCCATCTTCTTTGCTGAT 0 0 5' arm Beta_vulgaris mirnest MIR396 0.000000003 vvi-MIR396a 0.0000000001 -68.2 ..((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((....((((..((((((((((........(((.(((((...)))))...))).))))))))))..)))))))))...((((.......))))....))))))))))))))))))))))))))).)))))). (-68.2)