mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCATCT AGTGGCGGTGGTGGTGGTGGTG TTCAATGGCACAACTCCGTTACTCTCCTTTATCATCATCATCATCATCATCTCGTCAATTTTCTCTCTCCTCCATTAATCGGATTAATTCAATCTCATTCCCTCTGAATCAATCTTTGAATCTCCAATCAAAATCCGCCACGTCAGATCATCTCCTTCACCTTTGCTTCTCCTCCAACAATGGCGGAAATGGCGGCGCAGGATCCATCGGCGGAAGTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGGAGTGGTGGAGATTCATCGGAAAA CCTTTTCCCATTCCCTCTTCTCAAAAGATCTACAAATTTTCATCACTCACTGTAAAAAAACCTCAGCCGCCTCTTTCATTTCGCCATTGATAGATCTTCAAGCTCCATTAATGGCGTCTTCAATGGCACAACTCCGTTACTCTCCTTTATCATCATCATCATCATCATCTCGTCAATTTTCTCTCTCCTCCATTAATCGGATTAATTCAATCTCATTCCCTCTGAATCAATCTTTGAATCTCCAATCAAAATCCGCCACGTCAGATCATCTCCTTCACCTTTGCTTCTCCTCCAACAATGGCGGAAATGGCGGCGCAGGATCCATCGGCGGAAGTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGGAGTGGTGGAGATTCATCGGAAAATAGCGACGAAAATTCATCCATTTGGGAGAAATTAGGGTTAATTGGGGTATTTATCAAAGGATGGAAATCTAGGGTTTCCGCTGATCCTCAATTTCCATTCAAAGTTTTAATGGAAGAACTTGTTGGTGTGAGTTCTTGCGTAATTGGTGATATGGCATCTAGACCTAATTTTGGNTTGAATGAACTTGATTTTGTTTTCTCCACATTAGTCGTGGGTTCGATTCTTAAC 2 0 5' arm Beta_vulgaris mirnest 100 100 -62.09 (((.((((.....((((((((((((...(((((((((((((((((.((((.(((((.((..(((....((.(((((....(((((.(((((.............))))).)))))((((........))))..(((((((........................................)))))))))))).))....)))...)).)))))..)))).)))))))))))))))))..))))))))))))..)))).)))... (-62.09)