mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCAGCAGTGGACGTCTATCGG GGTTGGATGTTCGCGGCTCAAG GGTTGGTCGGTTGGTTGGATGTTCGCGGCTCAAGGTCGTTGTGCTTGGAGGTCCATGTAAGAAGTCTATGTCCAGCAGTGGACGTCTATCGGCTGATAAGG GGCAAGTAAATATATTTTTTATTTTTAAGTAATAGATGTTACACAAATATAGAGTATCTACTTTAACTACCTGGCCCTACCTGCTTAACATTAAACAACATTGTTTTTAATCAAATCATTATTTATTTATTTCCTACAATGTGGTAGGTACATGTTTTGTTCTTAAAATTATTGAATTGTATAGATAAACAACTAATGTAGTATGCAATTTTTTCTTTTACAATTACCTAAATAATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATTATAAACACATATTCGGCTCACTGCTGAGTCGAGTCTCCCCCAGTAAGAGGGGTTAGTGCCTACCCGCACTCGGGAGACCCCGCACTGGAAAGCGTGGTTGGTCGGTTGGTTGGATGTTCGCGGCTCAAGGTCGTTGTGCTTGGAGGTCCATGTAAGAAGTCTATGTCCAGCAGTGGACGTCTATCGGCTGATAAGGTAAGGGAAGGCCAATGCCTAACCCCTCTCATTCTGACAGGAGCCTAATATGGGCCAGCATATTTGGATTACATTGGCAGACATCACATAT 3 1 3' arm Bicyclus_anynana mirnest 100 bmo-mir-2723 0.00008 -31.3 .....((((((((((.((((((((((.(((((.((...((.(((.(((....))).))).))...)).))...))).)))))))))))))))))))).... (-31.3)