mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCACTCTTACAGTGCCCAT GGCCATTGTAAGAGTAGAAGGA TAGTTATAACATCTTGATCAATGGCCATTGTAAGAGTAGAAGGATCCATGAAGCAATAACTCTCTTTGCTAAAATGTGTGATAAAACATTGACTCCTGGTATTTCACTCTTACAGTGCCCATTGATTAAGATGGTATAATG CAGTAATCTGGAGAGAAACCTTCGCAGATGAGATGACAGGGCGGCGACAAGCGTTTTTAGGGTTTCTGCCGCCGCTTTTCGCTTACAACAATAAATAGGTGGGTGGACATTGTTTGCAGAGACATTGGGATGGTTTTAAAATTTAGTTAAAATATAATGGGCAGCAAAGGTTACTCTTCTGGCTTTCATAGTTATAACATCTTGATCAATGGCCATTGTAAGAGTAGAAGGATCCATGAAGCAATAACTCTCTTTGCTAAAATGTGTGATAAAACATTGACTCCTGGTATTTCACTCTTACAGTGCCCATTGATTAAGATGGTATAATGTTGTTACNAAGGGATGGATTTCTTCTCNAAAACTGCACCTCACACGTTGTACCATATCTCAACGACAAGGTTGATAGANGATCTTTGTGCATTCATCCACGGTAAGNATGCTAATGGATCTCTCGTCCGATGGCAAAATTATAATGTGTTTCTATGANGAGATTCTCGAAATGGGGATTTCAATTGAAGTATCATTTTCAGCTCAGCAATGCTGTGGAGGTCTTCCTTCAAAGCAGTTAGGCTGCAATAACTCATGTAAGTTATTGTTACCCAATTTGTCCNCCTTAANAACGGGANAATCTACTATTTCCTCTTCATATGGTGATGTGTCTTGGCTATAGGTCCTGCTGTNT 1 1 3' arm Populus_tremula_x_Populus_alba mirnest MIR475 5e-38 ptc-MIR475a 4e-66 -50.9 ..((((((.(((((((((((((((.((((((((((((.((((...(((.(((((((.........)))))..(((((........)))))...)).)))..)))))))))))))))).))))))))))))))).)))))). (-50.9)