mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACTGTTTCAATTCCATATA TAAGGAATTGAAACAGCGCCA GATACAGTGACGACGCGATTTTCTAAGGAATTGAAACAGCGCCATCTATTGGCACTACTGCACAACTGTTTCAATTCCATATAAATTCGCGTTTACGTTAACG CCATAAATTTCTTTTTATTTTAAAACCTATAAGTACAATTTACACAAACAAATTTTACAGTACAAGTTTGATATAAATATTCATTATTCATACATATTACAACACAAATGGTTATTATATTATAGGTATGTTATATTCGGGATGGGCCTTACAAAGTACTAAACTCTTTGTCAAGTTTAATCAGAGGGCCTTGTGGCAGTTTGATACAGTGACGACGCGATTTTCTAAGGAATTGAAACAGCGCCATCTATTGGCACTACTGCACAACTGTTTCAATTCCATATAAATTCGCGTTTACGTTAACGCGATAGTAAGAGTATGAAAATATTGAAAACTCCCACTAGGCACCCTGTTTGTACAACGTAAATTGAACTAGTTTTCTTGTTTAACTAAGGTATTA 5 0 3' arm Bicyclus_anynana mirnest 100 100 -33.2 .......(((((((((((.(((.((.(((((((((((((.((((.....))))............))))))))))))).)).))).))))))...)))))... (-33.2)