mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACCAAAGGCCTCTGCCCTTC AGGGCAGAGCTTTAGGTTTT TGTGAGGACAAAATTCTTGACTGGAGGGGGACACCAAAGGCCTCTGCCCTTCCATCCCCTTGGATTAGATAGAGGGGAGGGCAGAGCTTTAGGTTTTTCATGTGGTCAAAGGAGTTGAACAATTG CCCCGCGGCTGCAGGCCCGTCTCCACGTGGATCTGTTCCCGGGAGTACCCTAAAAAAAAGGAACCTTTCCTCTCCCCAGCCGTTTCCGGTTAAGAAGATGTGAAAGCGCCTCTCTCTATATAAATATAAGAACGGTGCGTTCCGAGGTGTGAAGTGGGAGAGAAGGGATTTCATAATTGGATTGGGGTTTTGAATAAGACGACCTTTTCATTTTTTTTTCTTTTTGAATTTGAAAAAGTAATAAGAATGAGAGGTGTTAAGCTTTTTATCATCCTGGTGTCGAGCTATTTTTCCGCAGGACCTCCCCTACAGTATCGTCACCGCATTAGAGTTTAACCACCAAGTTCGGGATGGATTGGTGTGGTTCCTCTACGCCTAGGACACCAGAATATCGAACTATGAACGAATAAAGGCATGAGAGAAAAGCATATTGGCTAGTGATTGTGAGGACAAAATTCTTGACTGGAGGGGGACACCAAAGGCCTCTGCCCTTCCATCCCCTTGGATTAGATAGAGGGGAGGGCAGAGCTTTAGGTTTTTCATGTGGTCAAAGGAGTTGAACAATTGGTTTTTTCGTGTTGTCAAAGAGTTGAATAATTGAAAATAAGGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCGGGTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGAAGCCTCACCTGGTTACATTCCCGCCCTTCCACTTGAAACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGCCTCGCCGGGACCTTCTCTTGATTTCTCAAAAATTCCTGGCCCTCCACCCCCGCAGGGGCAAAAAACCCCTTCGCTGTCTTGGGTGGGGCTACCGGAGGCTCCTGGGGAAGCCGGAAAAAGAGAAAACCTCATCTTTGGGGGGGGCTTTACAACTAAAAAGTTTTTCCACCATTATCCCGCCCCCCAATTGGGATACCCAATGGTTTAACGGGGGGAACAAAAACCGGGGAACCCCAAAGGGGGTTCCTTTCCCGGGCCCTCCCGACTTAGGGAAAAGGCCCTTTTAAATGGCTTTAAACCGCCCCCCCCGGAAAAGGGGCCCAATTTGGCCCCCCGAAGTGTTTTAAACCCCCCCTCCAAGAACCCCTTTTTATGGG 5 1 5' arm Prunus_persica mirnest 100 100 -43 (((....))).((((((((((((....((((.(((.(((((.(((((((.....(((((((..........))))))))))))))))))).))).))))...))))))..))))))......... (-43)