mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTTTTGGTTGCTGAGAAAT TTCTCAACAACCAAACAAGCCAT CTCTCTCTCTGTGTTTTTGGTTGCTGAGAAATTGATAAGAACAAATTAAATCTTTTGCTATTTCTTAATGGTTTCCAAGAAACATAATGACCCATTTCCTTTGGGTTGTTTTTTGTTTTTCAGCATTTTCTCAACAACCAAACAAGCCATTACTTT TCACCAGATTGGATTAGTAACACCACGTTAAAAAATTGACAAATTTTAAGACTTTGTTTCCTCTGAAAAATTAGCTAGAAAAGTGGGGGAACTCCGAGGCCATGTTAAGCCCAATCACATCATATGCCCAAATGATGCTCAGCCTCAACCAAATGGGAGGCATTGGCAGCGGACAACTATCTTTCTCAATAGCATTACCATGGAACCCTCTACGACCTCTGCCTCCATTAACATCACCAATCCAATGCGCAGTGACCAAACAAGGCCAACGCTTTCTCACCAAGCTTGCAGCCAATGCCAGGGACGCCAAGGTCACAAACAAGTTGATTGCCAAATTCCTCACTTCTTCTACCAAGTCCATTGCTCTCAACACTCTCTCCTATCTTCTCTCCCCTGATACCACTCTCCCCCATCTCTCTTCCCTCGCCCTCCCTGTAAGTCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTTTTGGTTGCTGAGAAATTGATAAGAACAAATTAAATCTTTTGCTATTTCTTAATGGTTTCCAAGAAACATAATGACCCATTTCCTTTGGGTTGTTTTTTGTTTTTCAGCATTTTCTCAACAACCAAACAAGCCATTACTTTTCATTTCAGCTAAGTTATTCATTTGGGTTTTCTTCAGTTCTACTCAAAAATCACAGAAGCGTCTTGGTTTGAATGGAATCCCAAGTTGGTAGCAGCCCTTGTTGCCCTGCTCGACAAACAAGGCCAGCACAACGAAGCAGAAGTTCTAATCTCTGAAACCATTTCCAAATTANGCTCTAGGGAACGAGAGCTTGCTCTTTTTCATTGTCANGTGGTTGAATCACACTCTAAGCTAAGTTCAAGCATGGATTGATAGTTCCTACAGTACCTCTATCAGCTTCTCAAAATCTTTCTCTGTTATGTCAAA 3 2 5' arm Prunus_persica mirnest 100 100 -34.9 .........((.(((((((((((.(((((((.((..(((((((((.....((((..((((((....))))))....)))).....(((((((((.......))))))))).)))))))))...)).))))))).)))))))..))))))....... (-34.9)