mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCTTCCTCTTCTTCTTCTT GAGAGTTTGGGAGGAGGTT CATATTCCCAAGCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTTTGCCATGTCAACTGAATCTTCTGGAAAAGTGAAAGTAGAAGGGGAGTGCATTCATTTCGGTGGAGAAATCGAGTAGGGGTGCATTTCTGTAAATACTTGGGATTCTTTGGGCTAACATTTTCGGTTTAGGTGGTGAAAGAAGAGAGTTTGGGAGGAGGTTAGGATTAA AGAGGCATCAACATCTGAGGTCTCATGTGGGTAAGAAAAGGGATGATGCATGTGCAAGTTCCATGACATGGGGCTTTCCCCTGGCGAGTCTGGTAGAGACCCCAAAGCATGAAATGTTGAAGGCACAGCAGCCGGCAATTCAGCAACTGAAGCAGGGTCCACTTGAGAAAGAGATCTTACGGAATCGACATTATCAGACCCAGAGTTACCAGACTTTTCAGATTCCTGGCTCAGTCTTGGTTTCCCATTATCCATATCAACCTCATCTTCAACTGCCATATTCCCAAGCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTTTGCCATGTCAACTGAATCTTCTGGAAAAGTGAAAGTAGAAGGGGAGTGCATTCATTTCGGTGGAGAAATCGAGTAGGGGTGCATTTCTGTAAATACTTGGGATTCTTTGGGCTAACATTTTCGGTTTAGGTGGTGAAAGAAGAGAGTTTGGGAGGAGGTTAGGATTAAAAAAAGGGGTGAATGGAAATTTGCCCCTTCTTTTTTGATGGTTTAGGCCAGATTCAGTGTACTCAGCAGCAGGGAAGGAAGAATCTTTGTACAATTTAATGCAGTTCAATTAGAATGTAATTTCCATCTGTCAGAAAAAAAAAAAAAACTGGTCAATATTGGCCGGCTCCATTTTTATGGGACATGTTGAAGTCAAAATTTAAATAGTATCATTGAAATTAAAAAAAAAAA 4 2 5' arm Prunus_persica mirnest 100 aly-MIR159b 0.0006 -61.1 ..((.(((.((.((((((((...(((..(((((.((((((((...(((((((.....(((.((((...(((((....((((((((((((..((((((......))))))...)))))))))))).....)))))......))))...))).....)))))))...)))))))).))))))))...)))))))).)).))).)). (-61.1)