mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGAGAGTATTATAAGTCAC GACTTATAAAGATCTCATGAT AGAAGTTGCTGAAGATTGTTTTATGAGAGTATTATAAGTCACCGCATTTGGTAATCAAGTGTTGCTTTCCCAAACGAAGTGACTTATAAAGATCTCATGATTAATCGATTTTTTGCAAG CGCCGTTTACATTGTTACTCACGAAACAGAGCTCTGGATCCATCTCAATAAGCTCGAGCAAGAATCGATCCATTGAGATTGCGAAGAAAGAAACTTCATAATCTGAAAAGGTGGGATGGAAAAGGATCTCAGGGTATTTGGATCCGGTTAAGTATATAACAAAATGTTTATGCAGATATCATTTACTCTCTCTCTTTCTTGATTTATCTTTTCTTGAGAAGTTGCTGAAGATTGTTTTATGAGAGTATTATAAGTCACCGCATTTGGTAATCAAGTGTTGCTTTCCCAAACGAAGTGACTTATAAAGATCTCATGATTAATCGATTTTTTGCAAGGTCTTGAAGAGAGTAAAGGACCATGATGTCCTGAGTGAAAATGGATTTATCTTTTTGTAGTCTCCTCTTCTAAAAGAGTAATGTCAACATACACGGAAATGATTTCAAATTCTAAAAGTGTTGCTT 3 0 5' arm Brassica_napus mirnest 100 ath-MIR400 0.000000000000007 -33.9 .....((((.((((((((..((((((((...(((((((((((....(((((.((.(((...)))..)).)))))....)))))))))))...)))))))).....)))))))).)))). (-33.9)