mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCGGTTCAATAAAGCTGTGG ACAGCTTTCTTGAACTGCATC TCCATAAACGATGATCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCCATGAGATCGATCGATCTTTGCATGTGAGGCTGCAGTCACTCACTCACTCTCTCTCTAACTGGCTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGTTCAATAAAAAATC CTCCATTTCCTCCATAAACGATGATCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCCATGAGATCGATCGATCTTTGCATGTGAGGCTGCAGTCACTCACTCACTCTCTCTCTAACTGGCTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGTTCAATAAAAAATCACTATCCGATCTTCAGCATCACACATATATATATTTATATCTTGGTATGAAGCCTAAACTTACAATTTACAAAGACATTTTAAATCACTCAAATTTTGTCTCACTTTGCACAATTGTCACTTGATTTGTTTCTCAGTACCCATAAAAATTCAATCTTTCATGATTCTGAAGCACGTGGTGGATGATGGGTGCTTACTTAAACCTGCTCCAACGAAAATGGCCTTGTCCCTCCCCTTCTACCTGAGCTACTCCAGCCATAATAACACCTCAAACCACAGCCACACCCAGACTCTTATTTTTTCTTCATCTAATTTTCACCATCGCCCCCCTCCCTCCGTTTCGGTCCCCCGATTCCCCCGCGCCCACCCCACATCCTTTATCTATCCCCCCTCCACAATTCAATATAATAAAACTTCCACCCCCCCCCATAATACAACCCACAATCTCCGCATTACCATCCCCACCATTACCCGACCCACCTCCTTTATTCCCGCCCCCCATATACCTCGACTTGTCATACAAATACTACCACCCCCCCCCCCATCCTATCCTCCTCCGCATTTCTCTTCCCACCACCATTCCACACCCCACTTAAATATATCCCTTTTTCATGCTAAAACCGCCACGCCGTTTACCGACACTTTATTACTCCGTATATTTCATTTTACCCCCCCCCCCCCC 1 0 3' arm Prunus_persica mirnest MIR396 0.0000000000007 csi-MIR396b 0.000000000000002 -57.9 ...........(((.(((.((((((((.((((((((((((.((((((((((.(((.((((((....))))))((.....((((.((.(((.....))))).))))....))..)))..)))))))))).)))))))))))).)))))))).))).))).......... (-57.9)