mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTGTATTCTTCCACAGCTT GCTGTGGGAAGATACAGATAG CTCCATAAACGATGATCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCCATGAGATCGATCGATCTTTGCATGTGATGCTGCAGTCACTCACTCACTCTCTCTCTAACTGGCTTGCGGGTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGCTCAATAAAAAATCA TTTTTGTTCATGTTGCCATCTCTGCTTTTTGACAATTCTGCCTCATCTCAAATGGGAGCTCTGATTGGTTGAAGCTTCTAAACATCTTATCTCTCTATGTGTGGTGTGGCTTTGGTGACTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCATTTCCTCCATAAACGATGATCCTCTTTGTATTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCCATGAGATCGATCGATCTTTGCATGTGATGCTGCAGTCACTCACTCACTCTCTCTCTAACTGGCTTGCGGGTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAGATAGGCTCAATAAAAAATCACTATCCGATCTTCACCATCACACATATATATATTTATATCTTGGAATGAAGCCTAAACTTACAGTTTACACAGACATTTTAAATGACT 2 0 5' arm Prunus_persica mirnest MIR396 7.0E-13 csi-MIR396b 2.0E-15 -54.2 ............(((.(((.((((((((.((((((((((((.((((.(((((.(((.((((..((..((....((...(((((......))))).)).))..))..))))....)))..))))).)))).)))))))))))).)))))))).))).)))........... (-54.2)