mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT ACAGGGAACAGGTAGAGCATG AGACTGATAAGACAGGGAACAGGTAGAGCATGGATGGAGTTCCCAACAGAAAAATAGAGCTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTGCCGTCCT TAGAAATAAATACACAGAAAGGCCGGCAAGGGTTAGGGAAGGGACAAATTAATGTATCTACGAGTTGCAGACTGGTGGGTGGCTGGTGACAATTGAAATTAGAGGAGCTGATGAATGAGGTGTGTGCAAAAGCCAACAAGAGGTAAATCATCCTATTAATTACATATAAATAATAATATAGGGGGTGGAGAAAATGGGAAAGAGACTGATAAGACAGGGAACAGGTAGAGCATGGATGGAGTTCCCAACAGAAAAATAGAGCTGTTGTGGCTCTACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTGCCGTCCTCAGTCTTCCTTTTCTCCTCCTCTTAATTTACTCACCCCACACCCTTAATTTCTTAATTTCTTTCATTTCTACCTCATGTTAAGGTTAAATGTGGTTAAATATGGGCTTTGCAGTGTAACAATGCCAAAAGACACAGCACGACTGTGGTTTTTGAATAAAATAAGTTTCTCTGTTTCCTGTCTCAA 3 0 3' arm Prunus_persica mirnest MIR408 0.0000000000004 ptc-MIR408 0.0000000003 -43.3 .(((.....((.(((((((.((((((.((((((.(((((((..((((((..........)))))).))))))).)))))).)))))).))))))).))...))).. (-43.3)