mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGC AGGAAGACGAAGAGAGAGAGAGAGGCCTTGCATGGCGATGAGGGCTTCTTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGATAGCTTGATCCATTGCATGTATGTATGTGATCTCTCACTATGTACAACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCCGAGTGGCCCTCACCCTTCATGCCAGCCCCTCATCTCTTCTCAAACCGTA GTCATCTACCAAAAAGAAGGAAGGAGGAGGAGGAAGACGAAGAGAGAGAGAGAGGCCTTGCATGGCGATGAGGGCTTCTTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGATAGCTTGATCCATTGCATGTATGTATGTGATCTCTCACTATGTACAACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCCGAGTGGCCCTCACCCTTCATGCCAGCCCCTCATCTCTTCTCAAACCGTAACCCATTCCTAGCTAGTTGTACATGACGCCAACCACTTCAGTTCAACTGGACTTCTTCCCTGCTTCCTCTTTGATCGATTCACTCTACCTGATCTGTAAATTTGTGCATGCATGCAGAAAAAGCCGTTCGACCAAGAGAGGCCAAAGAGCCCATGCGCGCTCGCTCGGAAGAGGACAAATCATCATCGGTTCATCACTCCCTGCACCTCCACGTAGTACAGTACGGAGGACCCACAAATTGCTCTGTTTGGATCCGTAATTCTGCTCAGTAAGAGGTGCCATACTTAGATGATTCGCTGAATCATGATTCATGTGCTTCGAACCGATTAGCTGGCTATGAGAAGCAGTTGCAGTGCATTAGCATTTTTTTCATGGGACGATGCAGGATCCTTGATGTAATATTTATTATGTTTAGGGTGGCTTGTAATTCTTATGAAACCTTTATAATAAATCTGGTTCCCTTTTCNNNAAAAAAAAAAAAAAAAATGC 0 2 5' arm Pseudoroegneria_spicata mirnest MIR169_5 0.00000005 zma-MIR169k 0.000000003 -80.1 .((..((.(((((((....(((.(((...((((((...((((((((..(((.((((((((((((.((((.((((((((((......))))......((((((((.((((....)))))))))))))))))))))))))))))))).)).))).))))))))....))))))..))).))).)))))))))...))... (-80.1)