mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTACTCACTCCGTCCCATGAT GCTGGGACGGAGGGAGTACAT CCCTTTACAACCTACTCACTCCGTCCCATGATGTAAGACGTTTTTGCAAGCTGGGACGGAGGGAGTACATGGCAAAGC ACCGATTTTTNNNTTTTTTTTTTACTCAAAGCTGGATGTACTATTGTCAGTATACTATATACATGTAACATGTCCCTATCGAAGGGCCTACACTAAGATCACAAAGGTGGTGAGCTCCACAGTGCAAAAAAAAAAAAAACCTACCCTTTACAACCTACTCACTCCGTCCCATGATGTAAGACGTTTTTGCAAGCTGGGACGGAGGGAGTACATGGCAAAGCTTGTGGCAAAAGTCAAGCTATATGGGTCACCTTAAGCTTGGGCTGCCCACAAGGCATAAAAGCAGTATTCTCTCTTCTCTACATCAACAAATAACGTGGCGTACCTTACTGTAAAATGTGATCTTATAGACTCTGTATTTCTCCAAGCTATGTAGATCCCAACTCCCAAGGTTATACACTAAGGATGCCCTGCAGATGTGGTTTGCGACGACGACGACATAGTTGGGTTGTCCGAGTCCGAGTTAACGCCGCTCCTCGGGCCTTCCGACTGCCTACTCGACTGCTTTTCTAAGTGTGGCTTCAACCCTGATGGCAACGTCACCGTCGGAGCGTATACTTGGTTCGCGCTTCCCGACGCAACATTGGTTGCATCTGCTGCTGCCGCGGCGGCGGCTGCAGCGGCATACTCCTGCTGGGGAACCCANNTGCAGCTGCCCACCA 5 0 5' arm Pseudoroegneria_spicata mirnest MIR1122 0.000004 tae-MIR1130 0.0000000009 -27.4 ..((((.((...(((((.((((((((((...(((((((...)))))))...)))))))))).)))))..))..)))). (-27.4)