mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATGTTCATCATCATCCTGT AGGGTGACCTGGACAAGATG TTGTTGCATCATCATGTTCATCATCATCCTGTCCCACAATGCGGTCAAAAGAATCATCAAAGCTGCAGCTCTTCTCAAAAGAAGGGCAGTTCTCTAATCCATTGTCAGAACCTGTTGTCTCACTGCCAGTAACTTTGTCAACGGAAGAGCCATGGCTCGACACTCTGCAAACTCTTGCATTCCAATATTCTTTCTCACATGCAGAGGAGTTTCTGGGTATCTGACTTGCACCAAATCTATAACCTTCAGTGCCTAATACTTCTGATTCTTGAATGTTTGATAAAGGGTGACCTGGACAAGATGATCTCCGA CTCTCACAACTGTCAATGCTATAAAGGAATCCTGCTCATCATCATGCATTGTTGTTGCATCATCATGTTCATCATCATCCTGTCCCACAATGCGGTCAAAAGAATCATCAAAGCTGCAGCTCTTCTCAAAAGAAGGGCAGTTCTCTAATCCATTGTCAGAACCTGTTGTCTCACTGCCAGTAACTTTGTCAACGGAAGAGCCATGGCTCGACACTCTGCAAACTCTTGCATTCCAATATTCTTTCTCACATGCAGAGGAGTTTCTGGGTATCTGACTTGCACCAAATCTATAACCTTCAGTGCCTAATACTTCTGATTCTTGAATGTTTGATAAAGGGTGACCTGGACAAGATGATCTCCGAGGGAAAAAGGTACCCTTTCCATCTTTCAATCCCCTGCTCCAAGTTCCTACATACGAGCTTCCATATACCCAAGTGTAAATACCATGACCATGTTCTACACCATCAAGCCATTGTCCATTGTACTTATCCACACATGCCCATGTCAACGTACCTTTACCACACATAGCTCCTGATTTCCACTCTCCAACATACTCA 5 1 5' arm Adiantum_capillus-veneris mirnest 100 100 -67.1 .......((((((.((((((...(((((((..........(((.(((..(((((((((..(((((..((((((((..((((...((((((....((((...............))))....)))))).....))))......))))))))..))))).))..(((((((..............................)))))))((((...((((((.((((.....................))))))))))..)))).)))))))))).))).......)))))))..)))))).))))))...... (-67.1)