mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCGTCATCGTCATCATCG GTGGTGATGGTGGTGATGAAG AGACCTTATCATCATCGTCATCGTCATCATCGAAGGTGGTTGCTGGTGGTCCCTACTTGCCGCCGGTAGCCGGTAAGAAACTTGCTCGCAGTAGGAGGGGAGTTCTGGTACTCAAAGCCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCGTCGGCAGTGGTGGAAGGAGACTCCTCCTCCTCCTCCGTGAGTTTATTGGAGCGTTGCTTGGCAGCGCCACCGGCTGTTTCTTCTTCTTCTATGCTGAGTCCGGTTATGAAAGGGCAGTACGGTGCGTTTGGTGCGGTTACCTTGGAGAAAGGCAAGCTTGATACGTCCCAGAAGCAATCCCAGTCTAGCCCCGAGACTGCAATCGGGGGAGGTGGTGGAGATATTGGAAAGAAAATAAATCATGGTGGTGGTGATGGTGGTGATGAAGATGGTGAT CCCCCTTCTTAGAGAGAGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAACTCCTATCCTATGTAATTTTCTTGATATCCAAACAGAAAAAAAGAAATGTCTCACGCGGTGTTCCAAACGGCGCAAATTATGCCGATAAAGACCTTATCATCATCGTCATCGTCATCATCGAAGGTGGTTGCTGGTGGTCCCTACTTGCCGCCGGTAGCCGGTAAGAAACTTGCTCGCAGTAGGAGGGGAGTTCTGGTACTCAAAGCCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCGTCGGCAGTGGTGGAAGGAGACTCCTCCTCCTCCTCCGTGAGTTTATTGGAGCGTTGCTTGGCAGCGCCACCGGCTGTTTCTTCTTCTTCTATGCTGAGTCCGGTTATGAAAGGGCAGTACGGTGCGTTTGGTGCGGTTACCTTGGAGAAAGGCAAGCTTGATACGTCCCAGAAGCAATCCCAGTCTAGCCCCGAGACTGCAATCGGGGGAGGTGGTGGAGATATTGGAAAGAAAATAAATCATGGTGGTGGTGATGGTGGTGATGAAGATGGTGATGACGATTAATACTTTGATGACTTTGATGATGGTGATGAAAGGGGAAGAAGGGGGGCCAATTAAGGAAAAGTAAATTTCTT 0 0 5' arm Quercus_petraea mirnest mir-598 0.00003 100 -136.1 ..(((..(((.(((((((((((((((((((((...(((((((((((((((........))))))))).((.((((((...)))))).))...((((((((((....(((.......)))..))))))))))(((((((((...(((.......))).)))))))))((((.((.(((((((((.(.((((.((((.((((.(((((((.((((((.(((((((..((.(((.(((...((((....))))...))).))).)).))))).))..)))))).))..((((.....))))))))).....)))).)))))))).....((((((.......)))))))...))))))))).)).)))).((((........))))))))))..))))))))))))))))))))).))))))... (-136.1)