mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAAGAGGCAGTGCATGGGAA TCCATGCTCTGCTTGTTCCCT GGAGGAGAAACAGGGAGCCAGGGAAGAGGCAGTGCATGGGAAGAGACCAAACATAGTCATTTGATGTTTTGGTAAAAACTCGATCCATGCTCTGCTTGTTCCCTGTCTCTCTCTCGTTACCA CCCACGCGTCCGAGAATCTGGACACCTTCATCGACGCCCTTCTCTTGCGCCAAGAAATGGATGCCATTGCCTCTTTCAGCTCCACTTCATGAACAGAGGTAGACCCGAACTCTGAGCTCGTCTTAAGTTCATCATCAGCTGTCAAAAGTCGTTAGCAGTAGTAATAAAATATTGATTAGAAGAAAGCTAGCAAAAAAAGAGAAGGGAGGAGAAACAGGGAGCCAGGGAAGAGGCAGTGCATGGGAAGAGACCAAACATAGTCATTTGATGTTTTGGTAAAAACTCGATCCATGCTCTGCTTGTTCCCTGTCTCTCTCTCGTTACCACTTTTGTCCTCTTCATTTCTTTGTAAAACAGATTAAAGAAAAGCTTGCTTGTTTTACCTTTGAACTTGGCAAGTTCTTTGAGTTTATTTGATGATGTTGTTTTAATGACATAGGTTTAAATAGATATTGGAACCGTGTGTTTGTGATGTACTACACGAGGCATCACATGAGATATTTGTACTCTTTGTTATGGAAACTCTTGTACTGCGATCTAGCTTAGCTAATAATGAGTACACACAATTTAAT 4 0 5' arm Brassica_napus mirnest MIR408 1e-28 ath-MIR408 3e-32 -49.1 ((.((.((...((((((.(((((((.((((((.(((((((..(((((((((....(((....)))..)))))).....)))..))))))).)))))).))))))).)))))).)).)).)). (-49.1)