mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTTCCTCCGTTTCATAATA TTACGAAACGGAGGGAGTATA AGTGATAATAATACTTCCTCCGTTTCATAATAGTTGATGTTTTGGAAGGATAATTTTGTTTCAAATTAGATGAAGTTTTGAGATTTTAAGGTTACTTTAGTTTTATTGGAAACTGTTCAACCAATTAGATTTTACAGTCTTTTTTATTATTGGTTAATTGATTTTAAAATTATATCTTTAAAATATTTTTTAGTTAAAAATACAATTTTCTTAATTTTTGTGCACTATGGTAAAACATCAAGTATTACGAAACGGAGGGAGTATATCATAACA TATTAGGATTTCTGACAGTATGTGATACAATAACATGAATGTTGTCTCTCTCACTCCCTCTCACACACACACAACCACAAACTTAGTGACTTGTTCTAGTTGAATTTTTCTTCTATGTTAATGACTCGTCTTACTTGAATTGGGGAGAGTTTTTTGTGTTTACATCTACTAAAAATGGATTAAGAGTAGAGAAATTTGAAGATATACTTATCTAAATAAAATATAGTTCACCACAATTACATTACCACACATGGTTAGTATTCATCGTGTTGGTAGCCTAGTGGTAGTGTACAGGAGTTGGTTCTTTTGTACTCCGGATTCAAATCAATTTTGGGTAAAGTGATAATAATACTTCCTCCGTTTCATAATAGTTGATGTTTTGGAAGGATAATTTTGTTTCAAATTAGATGAAGTTTTGAGATTTTAAGGTTACTTTAGTTTTATTGGAAACTGTTCAACCAATTAGATTTTACAGTCTTTTTTATTATTGGTTAATTGATTTTAAAATTATATCTTTAAAATATTTTTTAGTTAAAAATACAATTTTCTTAATTTTTGTGCACTATGGTAAAACATCAAGTATTACGAAACGGAGGGAGTATATCATAACAACCCTCACCCATTCTTACATTTTGACATTACTTTTCACTACATCAAAACAAAAACAAAAATTCAAACATATGGGGTGATTGGTTAGTATAGCAAGTGTTTCAACTTAATTTGTACTTACAACTATAACCATAAACTATACCCTCTCTGAATTGATTTGCTCCGTTATTTCACAAT 1 0 5' arm Raphanus_sativus mirnest 100 osa-MIR819j 0.00001 -66.2 .((((((....(((((((((((((((.(((((.(((((((((((..((((.((((.(((((..(((((((.((.((((((((((((((((((((.(((((((((....)))))))...(((((((.(((((....)))))........))))))))).)))))))))))))......))))))).)).)))))))..))))).)))).)))).....(((((...)))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))).... (-66.2)