mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGAGAGAGATAACACAGAC CTGTTCTATCTCTCTCTTCCA AATCAATCTAGTTTGAGAGAGATAACACAGACGAAACAAAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCTTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACAAACCAACAAAAGTTTCAACCTTTTATATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGC GGATCTCCTCAAGCCATTTCGAAATCAATCTAGTTTGAGAGAGATAACACAGACGAAACAAAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCTTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACAAACCAACAAAAGTTTCAACCTTTTATATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCACGATGGCGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCTGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAGACCAGACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAATTACGAGCAGCTCTCTTAAACAAAAAGCAGCGATTGATTAATTTAAAAAGATTGTCTTTTTGATTGATTATTTGATGCTTATTTTAATGTCTTGAGAGGAGATTAGAGGAAAATGGTAATTAGTTGATGCAGTGAATCCTATTTTCATCTGCTACTTGCGATTCTGTAATAAATGTATGGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTATGTTGGAACATATGGATCGTTGGATTTATGTATGTAATGTATCCAGTATAGTTTTCTAAATCATCTT 5 0 5' arm Raphanus_sativus mirnest 100 ath-MIR2936 0.0000000000002 -47.6 ..............((((((((((..((((((((...((((.((((((....(((((((((((((........(((........)))............)))))))))))))....)))))).((((.................))))....))))....))))))))..))))))))))..(((....))). (-47.6)