mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGTTCGGGAC TCCCGCCTTGCATCAACTGAAT GGGGGGCTCAGATTCGCTTGGTGCAGTTCGGGACTGATTGGCTGACACAACCACATAGGTACTTTTGCCTTATTGGTTTGTAAGCATGGATTGGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCTCC GGGGGGCTCAGATTCGCTTGGTGCAGTTCGGGACTGATTGGCTGACACAACCACATAGGTACTTTTGCCTTATTGGTTTGTAAGCATGGATTGGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCTCCGATGGTGAAACGAGTCCAATTAGATCTGGAGAACAGTTTGATTCAAGTTCTAGGGTTTGGATTCTTACAATCCTCATATGATTTGATTTCTAAAGGTAGATAACCAGGATAAAAGAAAAAACGGTTTGACAAATCCACTGTATGATAAGAAGAAGATAGAGATCTCGTTACATGAGCAATCTCTTGTCTTGATTTTCTCTAAGAAGGAGCATTGACTTGGGTTTGCAGAGATGATTAATGGTTCTGCTTTGTTTTTCTTTTGGTTTTGTTAATGGGATCATCGGAGATGGGTTGCAGAGAAACTGGGTCCTGACTTTGCAGGAAAGGAACTTGACTTAGTCACATAGGCCGTGGGCACTACAAGCATTAGGTGGATGGGAGAATGAGCTTGATTACTGCCAAGAGCTCCTTGAAGCTGACGTCTTTAACAACTTTGCATGGAATCAGTATTATGAAACGGAGGGAGTAATTGA 3 1 5' arm Raphanus_sativus mirnest MIR168 8e-18 ath-MIR168a 1e-16 -58.5 .((((((((.((((((.(((((((((..(((((((((((.(((.(((.(((((...((((......))))...)))))))).)))...)))))).)))))..))))))))).)))))).)))))))) (-58.5)