mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGTTTGCAGTTTCACC CAGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTTGTTTTCATGACGATGGAAAGAGATGAGTGTAGATTAGATCATGTTTGCAGTTTCACCCGTTGACT GGAAAACCAATTACACTAGAAAAACCCTAGATACAGAAAATTTGATCTATATCTTTCTTTTTTTTTTAAAGTTTTTCTTGATCTGATTCGGTGAAGTGACGGTGCACAGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTTGTTTTCATGACGATGGAAAGAGATGAGTGTAGATTAGATCATGTTTGCAGTTTCACCCGTTGACTATCGCACCCTTAAACCCTAATTTTCATCTTTGATTCCCATCTCAGATTTCACAGTAGCTAGGGTTGATTTCTATATTTTGGTGTTTGAATCCAAATGACCTGTGTTTCTCTTTTTACCTTATTTAATTGAGAGATCTCTCTTTTTGTGTGGTTATATTTCTGTTCATCTGAATTTTTCATTTTCTACATTTGTATTTGTTGTTCATATGGACTCCGAGATTCTGTAATATTTTTAGGGTTATAGAGTTGCACGACTACATAAAAGATCAAATTTATCCAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 5' arm Raphanus_sativus mirnest MIR167_1 2e-27 bra-MIR167c 5e-37 -43.4 (((....))).(((((((((.((((((((((((((.(((((((((.(((..(((((.....))))).))).))))).))))...)))))))))))))).))))))))).......... (-43.4)