mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGTCTGACAGCCTCACT AAGGGAACAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTGAGAGATGAATGTGGAAACATATTGTTTAAACCAAAGCTAGGTCATGTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTG GGATGCAGGGCCGAGGCTCTAATCTCTTCATAGCCTTATTGAGTTTTGTCTATCGTTTTCTCTCTTTCTTCCCGTCTTAGCTGTATGCATTATGGTGCTCCCTTTAATTCACTGTTTCAGGCTTCTTTAATTCGTGGTGTCTCTCTCCTTTTTACCCCAACCATCTCCTTAAATTTTTAACATCTGTCCCTCAATTCCGCTCTCATCTCTTTCTGTAAATATCTTAACGCTCTTAAACCTCAAAGCATCATCTCTCTCTTCTCTCATCTCCTTTCTTTGTGTCATATCTTGTTTCCTTATTTTCTTTCATTGCCACAGTGTATGCATTTCCATTTTATAGTTCTCCAAGATTTCAACTTCCTTCCATTTCATTATATGAAATTTTTACAAGTTTTTGCCCGGGTAATTTGAAGACAAATCCACAAGGGAACAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTGAGAGATGAATGTGGAAACATATTGTTTAAACCAAAGCTAGGTCATGTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTGGTCTAGGACTATTCACTGATGAAACATTACACATGCGATTGAAAGGAAGTGGGAAGTCCCAAACGCACACAGTTCTACTACATGAAACCCCTC 2 1 5' arm Raphanus_sativus mirnest MIR167_1 6e-46 ath-MIR167b 2e-45 -48.6 ..(((((..(((((.((((.((((((((((((.((((((((...((((((((((....)))).)))))).)))))))).))))))))).))).)))).)))))..))))). (-48.6)