mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG CTCTTCAAGTCCATGCCATGCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTCCTCCCCCTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCATCTCCGAAGAAGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGACATAACAAGGACTC CAAAATGAATGGCAGCATATGGAGGTTGAAGAAGAGAAAGCAATAATGTGCAGTGTGTATCTGTAGCCTCTCAACTCTTCAAGTCCATGCCATGCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTCCTCCCCCTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCATCTCCGAAGAAGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGACATAACAAGGACTCTGCAATTCTGTAGTGAGATGTGATGTTAATTGGCTCTATGTAATATGTATGCAGATGTAAGTTACTCCCTCTGAATCCATCGTGTTCTATGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 5' arm Saccharum_hybrid_cultivar_CoS_767 mirnest MIR396 0.0000000000006 sbi-MIR396c 3e-20 -42.707 .......((((((((.(((..(((((((((((((((((((.(((((((....................................................))))))).)))))))))))))))))))..))).))).....))))). (-42.707)