mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCAAGAAAGCTGTGGGAAG TTCCACAGCTTTCTTGAACTT TCTTCAAGTCCATGCCATGCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTCCTCCCCCTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCATCTCCGAAGAAGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGACATAACAAGGACT CAAAATGAATGGCAGCATATGGAGGTTGAAGAAGAGAAAGCAATAATGTGCAGTGTGTATCTGTAGCCTCTCAACTCTTCAAGTCCATGCCATGCCTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTCTCCTCCCCCTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCATCTCCGAAGAAGGTCAAGAAAGCTGTGGGAAGAAATGACATAACAAGGACTCTGCAATTCTGTAGTGAGATGTGATGTTAATTGGCTCTATGTAATATGTATGCAGATGTAAGTTACTCCCTCTGAATCCATCGTGTTCTATGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 3' arm Saccharum_hybrid_cultivar_CoS_767 mirnest MIR396 0.0000000000006 sbi-MIR396c 3e-20 -42.607 ......((((((((.(((..(((((((((((((((((((.(((((((....................................................))))))).)))))))))))))))))))..))).))).....))))) (-42.607)