mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAGTTAGAGAAGTTTGACAT GTCAAAACTTTTCTAACTTTGA TAAGAAACAGCCAATGATACTCCTCCTTTTCTAAAATGCAGGGCGTTTTACTTTTGTCCTAAGTCAAAACTTTTCTAACTTTGAACAATTTTATAGAAAAATATATTGACATCTACAATACCAAATAAGCGCACTGTCAAGACATTTCATGGTGGATTTAATGAAGCTAATTTGATGTTTCAGATGTCTGTGCAATGTTCTATACACAGTGAAGTTAGAGAAGTTTGACATCGGGCAAAAATAAAATGACATACATTTTTGAATGGTTGGGGTAGTATACAATGGACTAC CATACACATTTACCAAGAGCGTACCTCGTTCATGGCGTGTATCTGAATCTCTTGAATACGGCTTAGTTGGGGTAAACGAGGGAATTATTTCAACAGAGGTAAGAAACAGCCAATGATACTCCTCCTTTTCTAAAATGCAGGGCGTTTTACTTTTGTCCTAAGTCAAAACTTTTCTAACTTTGAACAATTTTATAGAAAAATATATTGACATCTACAATACCAAATAAGCGCACTGTCAAGACATTTCATGGTGGATTTAATGAAGCTAATTTGATGTTTCAGATGTCTGTGCAATGTTCTATACACAGTGAAGTTAGAGAAGTTTGACATCGGGCAAAAATAAAATGACATACATTTTTGAATGGTTGGGGTAGTATACAATGGACTACTATGTGGCTGGCACATCAATATTAATCTGCCTTAAAA 2 1 3' arm Saccharum_hybrid_cultivar_CoS_767 mirnest 100 sbi-MIR437f 5e-21 -78.5 ........(((((.((.((((((.((..(((.((((((.....(((((((.((((((((...((((((.((((((((((((((........(((((((.....(((.(((((((..((((.(((((.(((.((...(((...(((...))).)))......))..))).))))).))))..))))))).))).....))))))).....))))))))))))))))))))...)))))))).))))))).....)))))).))).))..)))))).....)).))).)).. (-78.5)