mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTGTCTCAAGCTTGCTGCC TGACAAGCTAGAGGCAGCAAC TGCAAGGGGTGGTGACAAGCTAGAGGCAGCAACTGCATATCTTGCAAGAAAATTGGTTTTCGAACCATACCGATAATTTTCTTGCANGTTGTGCAGTTGTTGTCTCAAGCTTGCTGCCTCCCTTTGC CCCACATCCTGCCGGGAGATTTGGAATCCAGCTCAGATTTCGCTTCCTCTCCCTCCGCCCGGGTGAGCCCCCGCGGGCGACGTGTGTCCCGTTGCCTTTCCTTCGCTTCGACGGCCACCTGTTGGCCTCGCATGGCTCTGCCTAGTAGCTAGTGCCTCCTGCCAAGCGTCCAAGCTCCCGCTCGCCCGGCGGCCAAGCGCCGCGGCGTCTATATATCCAGCCAGATCCGCGCGATCTAGCTATCCCCGCTAATCGCCGCACCCTGCCTCAACTTCTCTAGCTCACCCGCATCCCGGCTCGGCACGGCCTTCTCCTCGCACTTCCCTTCTCTGGTGTGATTGTATCTAGCCCCCATCATAACAATTCATCGGCAGCGGCGCGCCATCGTCGTCTCAGATTGATGCAAGGGGTGGTGACAAGCTAGAGGCAGCAACTGCATATCTTGCAAGAAAATTGGTTTTCGAACCATACCGATAATTTTCTTGCANGTTGTGCAGTTGTTGTCTCAAGCTTGCTGCCTCCCTTTGCCAAAACTATGAACAAAAGCACAGGTTATGTTATCAGTGAACACATTGGCACANATTNTAACTGATATATGTTGATAACAGACATGACGTTTAATTGGAATCTTGCAGCATGATACACACACAGCAGCTCTTN 2 0 3' arm Saccharum_hybrid_cultivar_SP70-1143 mirnest MIR444 4e-60 ssp-MIR444c 7e-55 -66.2 .((((((((.((((.((((((.((((((((((((((((((..((((((((((((((((....)))))........))))))))))).).))))))))))))))))).)))))).)))).)))))))) (-66.2)