mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTGTGCAACCTGCTAGCTCTCC AGACACGGGTGCACCTGAGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTGAGAAGTACATCATTGGAGATAACTGTGCAACCTGCTAGCTCTCCTTGGGGCATGCC 2 0 5' arm Branchiostoma_floridae mirbase let-7 5e-37 bfl-let-7a-1 4e-19 -50 ......(.((((.((..(((.(((.((((((((((((((((((.......((....))....)))))))))))))))))).))).)))..)))))).). (-50.00)