mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAAGACATGGGTAGTGAGAT CCCATTTCCCTGTCTTTCAACA GCTATAGTTGCCACCACATTGTGAAAGACATGGGTAGTGAGATTTGTATCATGAATTTATCCCATTTCCCTGTCTTTCAACAAGGTGTTGGCAGTTTAGCA 2 2 5' arm Branchiostoma_floridae mirbase mir-71 4e-25 spu-mir-71 0.00000008 -41.6 ((((...((((((.(((.((((((((((((.(((.((((.(((..((.......))..))).)))).))))))))))).)))).))).))))))..)))). (-41.60)