mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCTTGAGAATACACGTGA ACGGGTATTCTTGGGTTAATAAT GATAAATACGCACTGCTCGGTCACGGGTATTCTTGGGTTAATAATATACTATTTCTATATTATTGCTTGAGAATACACGTGACTGAGTGTGTGTGAGACTC 3 1 3' arm Branchiostoma_floridae mirbase mir-137 1e-50 xbo-mir-137 0.000001 -49 ......(((((((.(((((((((((.(((((((..(((.(((((((((.......))))))))))))..))))))).))))))))))))))))))...... (-49.00)