mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCGAGACGAATCTTTTGAGC TCAAAACATTCGTCTCACAA AAATTTTACAAGATTCCTCATCACATCGAATCTTTGGACGCATGCATGGAGTATTAAATGTAAGTAAACAAAATAACTAATTGCACAGTTTGTCTGTAAATGTCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAGTTAGTCCATGATTGGATAAATTTTACCAAATAACAACGAAAAGTGCCACAGGGACTTTACACCAACTTTTACACCATCTAAACACTACCTAAATCATACTATCATGTGGGATAGCAGCTGGTTGAGCAACAAGTTCAATTATACATACGTGCGTTGTTGTTTAAGCTACCTAATAGTACTGTAGCCGCCCCTGTGAAATTAAGGCTGTGTTTAGATCTAAATTTTGAAGTGCCCAAATACACTGTAGCCATTCGGTTGTATTTGGTAATAATTGTCCACCATTGACTAATTAGGCTCAAAACATTCGTCTCACAAAGTACAACCAAACTGTACCATTAGTTTTTGATTTTATTCACATTTAGTATTTCATGCATGTATTCGAAGGTTTGGTGTGACCGGAAAATCTTTTTTTT CCCTTTGTCTATCTTTGGTGAAAGAATCTATGATAACGTAAGGTGTTCGGCGAGATTTTCTTGAATTTACGGTGGGTCACGGTCCCTTTGTATATCATAGTGAAAAGAATCTCAGATAATATTGGCATGATTTTCTTGATTTTGCGGTGGGGTCACCGTAGCTCTAATTTTAACGGAAAACAAACACGCCCTAAGGCAGTGTTTACTTCCATCAAAATTTCAAAAATTTTACAAGATTCCTCATCACATCGAATCTTTGGACGCATGCATGGAGTATTAAATGTAAGTAAACAAAATAACTAATTGCACAGTTTGTCTGTAAATGTCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAGTTAGTCCATGATTGGATAAATTTTACCAAATAACAACGAAAAGTGCCACAGGGACTTTACACCAACTTTTACACCATCTAAACACTACCTAAATCATACTATCATGTGGGATAGCAGCTGGTTGAGCAACAAGTTCAATTATACATACGTGCGTTGTTGTTTAAGCTACCTAATAGTACTGTAGCCGCCCCTGTGAAATTAAGGCTGTGTTTAGATCTAAATTTTGAAGTGCCCAAATACACTGTAGCCATTCGGTTGTATTTGGTAATAATTGTCCACCATTGACTAATTAGGCTCAAAACATTCGTCTCACAAAGTACAACCAAACTGTACCATTAGTTTTTGATTTTATTCACATTTAGTATTTCATGCATGTATTCGAAGGTTTGGTGTGACCGGAAAATCTTTTTTTTGCATAAGGGCATTTTTTCAAGTGGATCT 1 1 5' arm Saccharum_officinarum mirnest 100 osa-MIR2124h 0.000000000002 -174.9 .........((((((((...((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((((...((.(((((((...((((((((..((((..(((.(((((((((.((((((((((((((((((.(((..(((((((...((((((((((.(((((((....((.((((.............(((((......((((((((((..(((.(((.......(((((.(((...((...(((((((((.....)))))))))(((((((.((.((.(((.....))).)).))...))).))))))..))).))))).))).)))..)))))))))).........)))))...........)))).))..))).))))))))))))))...))))))).))).)))))))))))))))))).))))))))))))...))))..))))))))...))))))).))...)))))).)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))..)))..)))))...... (-174.9)