mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAAGTACTAGTGCCGCAGGTGT CCCTGCAGACTGGTGCTTAACG AGTGATTGTCCTGCCCCATGCTAAGTACTAGTGCCGCAGGTGTCTGTTTATTGTACCCCTGCAGACTGGTGCTTAACGTGGAACAGGTAATAATGCCACCC 3 1 5' arm Branchiostoma_floridae mirbase 100 cte-mir-252a 0.000005 -40 .((((((((((((..(((((.(((((((((((.(.(((((.(((........).)).))))).)))))))))))).)))))..))))..)))))..))).. (-40.00)