mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGTCTT GGCTGGTACAAGAGCACGATC GAAGCTTTAGTGAAGTTTGATTATATATTACTCGACGGCTGGTACAAGAGCACGATCGATTAGGATATTGCACTTGTCCCGGTCTTAGGGTGGTATAAAAA 6 0 3' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 csa-mir-92b 0.0000003 -34.2 .(((((((...))))))).....((((((((((...((((((.(((((.(((..(((......)))..))).))))).))))))...)))))))))).... (-34.20)