mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTACCGTGAGTAATAAAGC CTTGTTACCTACGGTACCAGG TTTCGATGCTGCCTTGTTACCTACGGTACCAGGTAGAAAGTATGTCATCTCGTACCGTGAGTAATAAAGCATTCTCGGGAG 3 0 3' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 csa-mir-126 1e-36 -29.8 (..(((.(.(((.(((((((.((((((((.((((.((.......)))))).)))))))).))))))).))).).)))..). (-29.80)