mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCACTGGTAGAATTCACTG GTGGTTCAACAAGCGCCGTAAG CTGGTGTTTTCGGTGTATGGCACTGGTAGAATTCACTGCCAAGCCAGTGGTTCAACAAGCGCCGTAAGCTGGAAACACTA 3 1 5' arm Ciona_intestinalis mirbase mir-183 6e-39 xtr-mir-183 0.00000006 -37.6 .(((((((((((((.((((((.((.((.((((.(((((......))))))))).)).)).)))))).))))))))))))) (-37.60)