mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCACAGCTTTAGGCGGCCTGCT TAGGTAGTTTAAAGTTGTGGAG TAGGTAGTTTAAAGTTGTGGAGATTTGGACTCCACAGCTTTAGGCGGCCTGCT 3 0 3' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 cin-mir-196 3e-24 -29.1 (((((.((((((((((((((((.......)))))))))))))))).))))).. (-29.10)