mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGCCTGGTAATGGTGA ACCAACCACGTAGTATCGGA TTCGTGCCAACCGAATCACCAACCACGTAGTATCGGAGCATTGTGTGTCTAATACTGCCTGGTAATGGTGATTGGGTGGATACGTA 3 2 3' arm Ciona_intestinalis mirbase mir-200 2e-42 cin-mir-3575 3e-28 -39.3 ..(((((((.((.((((((((((((.(((((((..((.(((...)))))..))))))).))))..)))))))).))))).)))).. (-39.30)