mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAATAAGACGGATGGTCAA GACTGTTCGTTTTATTCAAAA ACATACTACTCCGTCCGGAAAAAAGTGACGTTTTTGACTTTTAGACATCGTGTTTGACTGTTCGTTTTATTCAAAAATTTTGTGCAAATTATAAAATAAATAAATTATTATTAAAGTATATCTAATGATAAAATAAGTCATAACAAAATAAATGATATTTATAAAAAAAATTTGAATAAGACGGATGGTCAAATAAGATGTCTGAAATTCTAAAACGACACTCTTTTTAAGACGGAGGGAGTATCATATAT ACATACTACTCCGTCCGGAAAAAAGTGACGTTTTTGACTTTTAGACATCGTGTTTGACTGTTCGTTTTATTCAAAAATTTTGTGCAAATTATAAAATAAATAAATTATTATTAAAGTATATCTAATGATAAAATAAGTCATAACAAAATAAATGATATTTATAAAAAAAATTTGAATAAGACGGATGGTCAAATAAGATGTCTGAAATTCTAAAACGACACTCTTTTTAAGACGGAGGGAGTATCATATATGTGCAAATACAAAGTTGTTCTTTTTTTTAATTTATGGATTTCTTACTTGTAGGTTCAATTAGAAAATCTTTTGAACACAACCATAGTTAGCACAAAATANGGAGAGAAAGGTGTGTGGGAAAGTGATGCATTACACATCAAGTGTTTGGAGAAGAGAAAACTAGACATTACATGACATGGAGTTAGGGGGTGTTGGTCTACCGGCA 0 0 3' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR806 1e-27 100 -78.8 ..(((((.(((((((..(((((.((((.((((((.((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.....))))))))...((..(((((((((.........)))))))))..)).(((((..........))))).(((.....)))..))))))))))))))))))))))))).))))))))))).)).)))))).)))).)))))..)))))))..)))))....... (-78.8)