mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTGGAACAGAGGGAGTATA TGCTCTCCTGTTCTAAAACT ATGACTTACAATTTGGAACAGAGGGAGTATAATTCTTTTAGTTGTCCTAAGGGACTTACAATTGGGCACACATGGACTATATTTCACTTCATTTTTGACATACATATAGAAATGTACTTTCATAGTGCATGTCTTTGATAATGCATATATTACTTTATTTTTGTATCAACTGGGGCGCAGTTATACGAGTTTGACATTATACAAATCTTATACAACTTACTATTTGGAACGGAGGGAGTTTAGTCTTATCTAACTATGGTAATCTCATCTTTGTGAACTCATTATGACTTTAGCATGTTGCTTCATATGTATTTGACTCGGCGTATACTTGAAAAATGATCAACGGGTCACTTGGTGTATCCTCCACTTGAGAGGCCTATGACTAATTATGGAACCCTCATGCTGACATGGCCATGTGAGTAACGCCTTAAAATGAATGGTGCTCTCCTGTTCTAAAACTAATGCCA ATGACTTACAATTTGGAACAGAGGGAGTATAATTCTTTTAGTTGTCCTAAGGGACTTACAATTGGGCACACATGGACTATATTTCACTTCATTTTTGACATACATATAGAAATGTACTTTCATAGTGCATGTCTTTGATAATGCATATATTACTTTATTTTTGTATCAACTGGGGCGCAGTTATACGAGTTTGACATTATACAAATCTTATACAACTTACTATTTGGAACGGAGGGAGTTTAGTCTTATCTAACTATGGTAATCTCATCTTTGTGAACTCATTATGACTTTAGCATGTTGCTTCATATGTATTTGACTCGGCGTATACTTGAAAAATGATCAACGGGTCACTTGGTGTATCCTCCACTTGAGAGGCCTATGACTAATTATGGAACCCTCATGCTGACATGGCCATGTGAGTAACGCCTTAAAATGAATGGTGCTCTCCTGTTCTAAAACTAATGCCAGAAGATGCCTTCTTCACGAAGGGTGCTTTCGTTTTTGGCACACAAATTTGAGGAGTACCTTTCTAAATTTAGCCAAGTTCGCCATCGGGGTAATACAATTACCTTTGGACCTACACAAAATGTTGCCAGTAAATCATGGTTCAACACTCTCTCGGTAAACTTCAGAACATTGGCCCGCATACTTGGGATTTCAAAGTCCTTGAAAAAAGCATTCTTATAA 2 1 5' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR1122 0.0005 ssp-MIR437b 0.000000006 -97.1 ...........((((((((((.((((((((.(((((((((((.((((....))))..))....((((.(((((((.((((..(((((........(((.((.((((.(((.(((((((.....))))))).)))(.(((((.((.((....(((((..((((((.((((.(((.....((((.((.(((((((........)))).))).)).))))..))).)))).))))))))))).)))).))))).)..))))...)).))).....))))).(((...)))..((((((((....((((((..((.(((....(((.((((((....((.(((((....))))).))))))))..(((.....)))..)))..))).))..)))))).....)))))))).)))))))))))......))))))))).)))).)))))))))))))))))).......... (-97.1)