mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGGCAGATCGGGACC TCCCGCCTTGCACCAAGTGAAT CCCGCCCCGCGCCGTCTGGGCTCGCTTGGGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCCAT CCTCCGGGACGACAGTGCGAGCGATTCCGATTCAGATGGAGATGTAAGCGACCCCCGCCCCGCGCCGTCTGGGCTCGCTTGGGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCCATACAGCGACCGACCGCCGCGCTGCTCTTGATTGCGATGCCGTAGCCTGCTTGTTGCGTGCTTTTATTTTTTCTGATAAGGATCATGCTGCTGATTGCTGTCGGTCTGTGTCGCCGTGCGGATTGCTGTGATTCTGTGTCGCCGTTGGAATTATTAGGCGCCGTGCGGATCTCTGCTCTAGATTAAGCTATCCGGATCTGGATCTGACGCGTAATTTCGGTAGTTTGATTTTGATCTGATGGGTTGGGTGATGACGTCTTTATTTTGCAGGATCTATTGTTATAGCAGGCTATGACAATCTGCTTTAATTTTCGATGGCAATTTTCTGTTCATAAATGAAGTTTCTGTGGTGACGTCTTTTGTGGTGCCAGGGAGGCTCGGGTTTGCCTGGGGGGTGCAAAATTGGCCGGCCATGGTGGCAGTCCTGCCCCTGGATCACGGGGAAACCATGCCTGCTGGATTCAACTTAAGAGAGATTTATTGATCTGACTGGTCTTACTGGCAGGGATGTACTACGAGCCCCTTGTAAGGGAAAATTATGGGTCGTG 3 1 5' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR168 3e-35 sof-MIR168b 9e-54 -52 ........(((((((((((..((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..)))).)))))))).)))))..))))))...... (-52)