mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTTCGTCCTAAAAT TTTAGGACGGAGGGAGT GAACAATATATATACTCCCTTCGTCCTAAAATATTTGTCAGAGATTTGTCTAAAGAAGTATGTATCTAAACATGTTTTAACTCTAGATACATCTATTTTTTGACAAATCTCTGACAAGTATTTTAGGACGGAGGGAGT ACTTACAACAAAACAACATATGACATATAGCACACCCATAAATTTGCTTTCACGAAACACACATACTTATTTACTTAACTGAACAATATATATACTCCCTTCGTCCTAAAATATTTGTCAGAGATTTGTCTAAAGAAGTATGTATCTAAACATGTTTTAACTCTAGATACATCTATTTTTTGACAAATCTCTGACAAGTATTTTAGGACGGAGGGAGT 2 0 5' arm Agrostis_stolonifera mirnest MIR1122 0.0000001 tae-MIR1128 0.000007 -69.2 .............(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.((.(((((((((.....((....))..))))))))))).))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))) (-69.2)