mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT CGCCGCCGCGCCGCCTCAGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCAAT GTCGACCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGGGCAGCGGGGAGAGCGAGCGGGACCGCAGCGGGCGACGTGCCTGCCACGCCTCCTCCTCGGCTCCTCCCTGTATCCAAACCATTCCACGCGAGCGAGCAGGGCGAGCGATTTCCGATTCGAGAGAGGATGTCAAGCGACCCCCGCCGCCGCGCCGCCTCAGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCAATACAGCGACCGACCGCCGCGCTGCTCTTGATTGCGATGCCGTAGCCTGCTTGTTGCGTGCTTTTATTTTTCCTGATAAGGATCGTGCTGCTGATTGCTGTCGTTCTGTGTCGCCGTGCGGATTGCTGTGATTCTGTGTCGCCGTTGGAATTATTAAGCGCCGTGCGGATCTCTGCTCTTGATTAAGCTATCCGGATCTGGATCTGACGCGTAATTTCGGTAGTTTGATTTTGATCTGATGGGTTGGGGGTGATGACGTCTTGATTTTGCAGGAACTATTGGTATAGCAGCTTTAATTTTCGATGGCAAATTTCTGTTCATAAATGAAAGTTTCTGTGGTGACGTCTTTTGGGTGCAAGGG 3 0 5' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR168 2e-45 sof-MIR168a 9e-51 -60.5 ....((.((((((.(((.((.(((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..))))))))))))).)).))).)))))).))... (-60.5)