mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCAAAAGATTCGTCTCGAC GAGACGAACATTTTGAGTCT TCCAATCATGGACAAACTAGGCTCAAAAGATTCGTCTCGACATTTACAGACAAACTGTGCAATTAGTTATTTTTTTACCTACATTTAATACTTCATGCATGCGTCTAAAGATTCGATGTGACAGGAAATCTTGTAAAATTTTTGGAAGTTTGAGGGGATCTAAACACTCCCTTCGTCCCCAAATTCCACTGTGCAAAAAGAAAATTCCCATCACATCAAAATACCGGCACATGCATGGAGTACTAAATGTAGATGAAATTAAAAACTAATTGCACAGTTTTATTGTACTCTGCGAGACGAACATTTTGAGTCTAATTAGTCAAAGTTTGA AAAGTTATTGTAGCACTTTTCGTTGTTATTTGGTAAAGTTTATCCAATCATGGACAAACTAGGCTCAAAAGATTCGTCTCGACATTTACAGACAAACTGTGCAATTAGTTATTTTTTTACCTACATTTAATACTTCATGCATGCGTCTAAAGATTCGATGTGACAGGAAATCTTGTAAAATTTTTGGAAGTTTGAGGGGATCTAAACACTCCCTTCGTCCCCAAATTCCACTGTGCAAAAAGAAAATTCCCATCACATCAAAATACCGGCACATGCATGGAGTACTAAATGTAGATGAAATTAAAAACTAATTGCACAGTTTTATTGTACTCTGCGAGACGAACATTTTGAGTCTAATTAGTCAAAGTTTGAACAATTTTTACCAAATACAAACCAATTGATACAGTACGCATTTAATACACACCGTGCAGATTTTGTGCCCCAAATTGGGATCTAAACACGGTCAACGAAAAAAGCAAACAGCAAAAGTGACGCTGCTCCTACGCTGCGTCATCGGCGTCCTCCCAACGGCTAGCTTCGCGTCTCCTGCGCTGCGCTGACGTAACCGCCGTCGCGCCATTCCCAGCCTTCGGCCGCGGTACTGACTCGGGTCCTCCTTAAGACGCCGG 3 0 5' arm Saccharum_officinarum mirnest 100 osa-MIR2124a 0.00000007 -117.6 ..(((.....(((.((.(((((((((((..(((((((((.((..(((((..(((((((((((((((((.((.(((((.(((((((((.(((((((((((((.(((.....(((.(((((((..((((.((((.....((...(((((...((((((((.........))))))))........)))))..)).....))))...))))..)))))))..)))...))).))))))))))))).))))))))).)))))..)).)))))))))))))))))..)))))...)))))))))))..))))))))))).)).))).....))). (-117.6)