mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGAACATAAACATAATAT ATTACTTTTATGTTCAG GTTGAACATAAACATAATATAAATAAATATATTTTATTTTAGCGGTAATTTGAAATACTAATCAATTGTTTTATATTACTTTTATGTTCAG 4 0 5' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 cin-mir-4027 1e-46 -18.1 ..((((((((((..(((((((((..(((..(((.((((((((.......))))))))..)))..)))..)))))))))..)))))))))). (-18.10)