mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACGCATTGGATTAAGGTGG ACCTTAATCACCAATGTGATTG AACACCTTAATCACCAATGTGATTGTGATAACAGCAAACGCATTGGATTAAGGTGG 2 2 3' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 cin-mir-4063 5e-26 -25.1 ..(((((((((..((((((((.((((.......)))).))))))))))))))))). (-25.10)