mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGTCTTTGCCCAACAGCAA TGCTGATGAACAAAGGCTTG AAGTCTTTGCCCAACAGCAACATGTTTCTCACCATTGCTTCATGTATGCTGATGAACAAAGGCTTG 3 1 5' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 cin-mir-4068 6e-32 -22.7 (((((((((..((.((((((((((...(........)...))))).))))).))..))))))))). (-22.70)