mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTTTTAAAACAGCAATTA ATTGCTGTTTTAAAAATA TATTTTTAAAACAGCAATTAAAATCGAAACCCACTTTTAAAACAGCAATTAACATTGGGGTTAATTGCTGTTTTAAAAATA 0 0 5' arm Ciona_intestinalis mirbase 100 cin-mir-4177 9e-41 -25.7 (((((((((((((((((((((........((((.(.((((........)))).).)))).))))))))))))))))))))) (-25.70)