mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTATGTTGTT GAGATACAACATGACTTACTCATCTCTGC TAGTAGTCTTGTTGTTGAGGTAGTAGGTTATGTTGTTGCGTGAATTACAACACACAGGAGATACAACATGACTTACTCATCTCTGCAGAAGGGCTACAGCTA 1 7 5' arm Ciona_savignyi mirbase let-7 4.0E-7 cin-let-7b 2.0E-8 -41.8 ..((((((((.((((.((((((((((((((((((((((.(((........))).))......))))))))))))))).))))).)))).))))))))..... (-41.80)