mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTATGCAGTT CTGTGTAACCTTCTGCCTTTGT GGGCTTCTCCCACAATGAGGTAGTAGGTTATGCAGTTTTTGCCTTGAATGTTTTTAGAGGCACAGGAGCTACTGTGTAACCTTCTGCCTTTGTGGCAGATG 3 0 5' arm Ciona_savignyi mirbase let-7 2.0E-42 cin-let-7a-1 5.0E-12 -43 .....(((.(((((..(((((((.((((((((((((....((((((..(((((....))))))))).)).)))))))))))).)))))))))))).))).. (-43.00)