mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTTGGTTGTATTGTT CTATACAGCCAGCTAACTTTACT GAGGCTATTCACAGATGAGGTAGTTGGTTGTATTGTTTTACACCTTCGGCGATAACTATACAGCCAGCTAACTTTACTGTGGTTGCTAAATATCGTCCAGCA 1 1 5' arm Ciona_savignyi mirbase let-7 5.0E-34 cin-let-7d 5.0E-6 -35.6 ..(((...((((((.((((((((((((((((((.(((...(.((...)).)..))).)))))))))))).))))))))))))..)))............... (-35.60)