mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC TTAGAGAGGGTAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTGGTATATATGAATATATGATGTCTTTACCTCTGATCTCTCCCTGACTGTCACGGATCGATGAATCCAGGATGAGGGGAGGGAATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGAGCACATCGAAAACCCTA GTCGACCCACGCGTCCGCTTCCCCGGCCTCTCTTCTCTCTCTATCTCTATCCCCCGGCCCTCTCTCGGATAGATGAGTAGTCTAGCTTGTTCCTGCTGCTCTTCTTCCTCCATTAGAGAGGGTAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTGGTATATATGAATATATGATGTCTTTACCTCTGATCTCTCCCTGACTGTCACGGATCGATGAATCCAGGATGAGGGGAGGGAATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGAGCACATCGAAAACCCTAGCTAGCTAGCTGTATTTAATTTCCATCCATGCGCTGAATCATCGATGGGTGTTGTCAGGTCAGTTCTTGTAGAATTCAAAAAAAAAAAAAA 0 1 5' arm Saccharum_officinarum mirnest MIR167_1 2e-16 sof-MIR167b 7e-81 -75.6 ......(((((....((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((..((((.....((..........))..))))((((.(((((((((...((((..((((......))))..)))).))))))))).))..)).))))))))))))))))))))))))).))).))))..)))).......))))). (-75.6)